本區位居台南市西南端，東鄰歸仁區、南以二仁溪與高雄市湖內區 、路竹區為界，北接永康區、西連台南市。地形呈現不規則南北狹長狀，除西面有一丘陵外，地勢低平。
主要河流有斜貫本鄉南北的三爺溪及五帝廟溪，分別注入二仁溪，流入臺灣海峽。
交通資訊：本區境內交通網便利，有中山高速公路設有台南交流道與仁德休息站；台一省道與東西向快速道路暨台鐵保安、中洲兩車站。